东晋时期，作为西晋灭亡后司马睿在南方建立的政权，其疆域主要集中在长江中下游和华南地区。相较于西晋时期的广大领土，东晋初期的实际统治范围主要包括现今江苏、安徽、浙江、福建、江西、湖北及湖南等地。

由于北方五胡乱华以及中原地区战乱频繁，大量汉族士族与百姓南迁至江南，形成了中国历史上的第一次大规模人口南迁现象，史称“衣冠南渡”。这些南迁的人民为东晋提供了稳定的人力资源和文化基础，使得江南地区得到迅速开发与发展。

东晋的行政区域虽不及西晋广阔，但依然沿袭了州、郡、县三级行政区划制度，并且随着形势变化对一些行政区划进行了调整。这一时期，东晋的中心在建康（今南京），而北方的领土大部分被十六国中的前赵、后赵、前秦等政权占据，直至南北朝对峙格局形成，东晋基本维持了南方的统一和相对稳定。